根据《厦门港总体规划(修编)》，未来，厦门港全港规划可形成码头岸线总长约94.3公里，规划泊位379个，规划可形成通过能力约5.8亿吨/年(其中集装箱通过能力2020万标箱/年)。
海沧港区：以集装箱干线运输为主，兼顾石油化工和煤炭等散货运输，积极发展保税港区和现代物流服务功能。
翔安港区：以承接东渡港区石材、散杂货和内贸集装箱运输功能搬迁起步，逐步发展成为以集装箱运输为主，兼顾散杂货运输等功能。
招银港区：以集装箱、杂货运输和临港工业发展为主，兼顾散粮、建材和客滚运输。
后石港区：主要为后方临港工业服务，以石油化工、LNG、煤炭等大宗液体散货、干散货运输为主。
石码港区：主要服务漳州龙海地方经济，以杂货和建材运输为主。
古雷港区：主要服务大型临港石化产业园，以石油化工运输为主，兼顾散杂货运输，是以工业港为特色的大型深水港区。
云霄港区：服务周边地区经济和临港工业开发，初步规划以散货和杂货运输为主，可承接厦门湾修造船等临港工业功能。
东山港区：以服务临港工业和地方经济发展为主，城 、铜陵作业区发展散杂货和对台客滚运输，冬古作业区以服务城市旅游为主，兼顾油品运输。
诏安港区：服务临港工业和地方经济发展，以散杂货运输为主。
厦门港口管理局蔡良涯局长表示，下一步，厦门港将支持东山建设“国际旅游岛”。同时，加快有关岸线、码头、建设的审批效率，优化审批程序，减少审批环节。
此外，厦门市财政还将加大对漳州市方面的倾斜和投入。从今年起近三年，每年投入1000万元用于漳州市港区公共基础项目建设。
